L’auditorium est un complexe de 115 places où se déroulent, notamment, les cours de l’école d’été, du DIU de Myologie, et certains colloques et conférences de presse de l’AFM.
L’Institut de Myologie permet aussi à ses partenaires, le Groupe Hospitalier de la Pitié Salpêtrière, l’Inserm, ainsi qu’à des organismes extérieurs, d’y organiser des colloques, des réunions et des séminaires de recherche, dont le caractère doit être obligatoirement médico-scientifique.